مرجان های خلیج فارس با دو چالش اساسی، یعنی تغییرات اقلیمی و دمایی مواجه هستند و مطالعات نشان میدهد که مرجانهای شاخ گوزنی جزیره شیدور استان هرمزگان به طور کامل از بینرفته اند.
حضور محیطبانان دریایی در خلیجفارسوی با تاکید بر اینکه اقدامات تخریب کننده مرجانهای خلیج فارس همچنان ادامه دارد، یادآور شد: من به سازمان عمران کیش پیشنهاد کردم که سایت مرجانی شرق کیش به مدت ۶ ماه تا یک سال مسدود شود. این اقدامی است که در کشورهایی چون تایلند و فیلیپین برای حفاظت از مرجانها انجام شده است. این امر در راستای کاهش فشارهای زیست محیطی بر روی مرجانهای خلیج فارس است.